Монтировка: Лом-гвоздодёр, обычно используется для того, чтобы расчищать путь, разбивая стёкла или завалы из деревянных ящиков, которые мешают проходу. Также можно использовать против враждебно настроенных персонажей. Эффективен только на близком расстоянии против слабых врагов и барнаклов. Кроме того, монтировка является символом Гордона Фримена и игры Half-Life. Даётся в главе «Непредвиденные последствия».

Пистолет (Glock 17/ Berreta 92F/FS c High Definition Pack). Обладает отличной точностью и наносит большие повреждения, чем выстрел из МР-5. Однако пистолет не отличается высокой скорострельностью, что заставляет использовать его только против слабых целей, вроде хедкрабов или лазерных мин. В отличие от других типов оружия, пистолет может стрелять под водой. Основной режим атаки — один точный выстрел; вторичный режим атаки позволяет стрелять очередью, но с меньшей точностью (эффективен, если нужно быстро уничтожить неожиданно появившегося рядом врага). Даётся там же, где и монтировка.

Револьвер (Colt Python): Имеет малую вместимость барабана — всего шесть патронов, и долго перезаряжается. Тем не менее, является одним из лучших видов оружия в игре, так как обладает высокой точностью (как Glock) и высокой убойной силой (по эффективности схож с арбалетом). Обычно применяется только в особых случаях из-за редко встречающихся патронов. Даётся в конце главы «Реактивная шахта».
Пистолет-пулемет или карабин (Heckler & Koch MP5N в оригинале, или Colt М4 с подствольным 40-мм гранатометом M203 при использовании High Definition Pack): Является часто используемым оружием, так как очень скорострелен и не дает врагу прийти в себя вплоть до его смерти. Лучше всего подходит для стрельбы на малых и средних дистанциях. Имеет подствольный гранатомет. ПП и подствольный гранатомет чаще всего применяются при большом количестве нападающих. Использует те же патроны, что и пистолет, но менее точен. При стрельбе очень сильно сбивается прицел. Даётся в главе «Мы встретили неприятеля».

Дробовик (Franchi SPAS-12): незаменимое оружие ближнего боя. Малоэффективен в дальнем бою: с увеличением расстояния урон сильно уменьшается. Чаще всего хватает одного выстрела для убийства «среднего» противника. Возможна стрельба сдвоенным выстрелом. Очень долго перезаряжается (впрочем, перезарядку можно прервать — выстрел можно сделать, если хоть один патрон уже заряжен). Также эффективен против большого скопления врагов. Эффективен против солдат и чёрных оперативников(на близком расстоянии). Но на тяжёлом уровне сложности против солдат эффективен револьвер. Из-за часто встречающихся патронов может стать основным видом оружия в игре (наряду с пистолетом-пулеметом). Даётся в главе «Офисный коплекс».

Арбалет с оптическим прицелом: Чёрный охотничий арбалет с силой натяжения 113 килограммов и скоростью полета стрелы более 110 метров в секунду. В стрелах арбалета содержится ампула с транквилизатором (в одиночном режиме). Арбалет также обладает дополнительным креплением для оптического прицела. Один из самых ценных видов вооружения, стрел для которого так же не хватает, как и патронов для револьвера. Хорош при стрельбе из укрытия по удаленным, не видящим игрока целям. Если стрелять без прицела — стрелы летят медленнее и при попадании взрываются (в мультиплеере), если стрелять, используя оптический прицел — стрела достигает цели быстро и не взрывается. Аналог снайперской винтовки. Вполне применим также на средних и коротких дистанциях. При увеличении расстояния необходимо учитывать поправку на силу притяжения, то есть «брать выше». Даётся в главе «Мрачные предчувствия».

Биологическое инопланетное оружие («Ручной Улей»,«Мухомёт», «Рука злого пришельца» или «Муха») (Инопланетное оружие): уникальное оружие пришельцев из мира Зен. Это оружие биологического происхождения, боеприпасы к которому со временем пополняются. Два режима стрельбы — поиск живой цели, стрельба плотной очередью по прямой. Минус орудия в том, что «обойма» вмещает восемь «мух», а после стрельбы заряд восстанавливается относительно медленно. Является живым организмом, непрерывно воспроизводящим свои «пули-мухи». При определенной сноровке вполне заменяет обычное оружие, что является преимуществом там, где встречается мало боеприпасов. Даётся в главе «Поверхностное напряжение».

РПГ (ATGM-4000): Многоразовый реактивный гранатомет, который заряжается через дуло. Великолепное оружие против различной техники или большого скопления врагов. Два режима стрельбы: посыл неуправляемого снаряда (можно выстрелить и спрятаться за укрытие) и возможно включение лазерного наведения, при котором ракета устремляется туда, где находится точка лазерного прицела, но в этом случае ракету нужно держать в поле зрения и «вести» до цели (например, если она движется). В продолжениях же режим лазерного наведения является основным и не отключается. Даётся в главе «Поверхностное напряжение».

Квантовый разрушитель (Глю́он, оружие Эгона, Пылесос): Секретная разработка правительства. Оружие испускает сконцентрированный луч энергии, который разрушает молекулы цели. У этого оружия есть второе имя: «Орудие Эгона». Глю́он получил такое прозвище в честь лидера «Охотников за привидениями» и создателя протонных ружей, которые внешне сильно похожи на Глю́он. Также, протонные ружья, при атаке, испускают такой же спиралеобразный луч. Кроме того, квантовый разрушитель — одно из мощнейших оружий в игре. Недостаток этого оружия — большой расход энергии (примерно шесть зарядов в секунду). Эффективен против сильных врагов и больших скоплений слабых. За внешний вид и характерный издаваемый звук это оружие иногда называют «пылесосом». Даётся в главе «Ядро Лямбды».

Тау-пушка (Гауссово ружье или Накопитель): Ещё одна секретная разработка правительства. Стреляет Тау-лучами. Следует отметить, что обычно в научной фантастике под термином «гауссово ружье» имеют ввиду совсем другое оружие. Обладает сильной отдачей. В альтернативном режиме происходит нагнетание энергии: ружье заряжается, пока не будет отпущен курок, и стреляет лучом повышенной мощности (чем дольше удерживалась клавиша, тем мощнее луч, однако слишком долго удерживать клавишу опасно для жизни — ружье не удерживает надолго заряд и «разряжается» на игрока ударом тока). Однако, заряженным пучком можно насквозь пробивать стены, тем самым уничтожая невидимых врагов, и с одного выстрела взрывать любую бронетехнику. При попадании луча в препятствие возникает сноп искр, из-за чего Тау-пушку русскоязычные игроки иногда называют «сваркой». Даётся в главе «Сомнительная этика».

Ручная граната: Осколочная граната. Эффективна для быстрого устранения деревянных завалов на пути, а также большого скопления врагов. Также, в ближнем бою противника можно ударить гранатой по голове. Даётся в главе «непредвиденные обстоятельства».
Лазерная мина-ловушка: Мина, испускающая лазерный луч, при пересечении которого происходит взрыв. Также она детонирует при выстреле в неё, произошедшем рядом взрыве или уничтожении «основы» (например, если разбить монтировкой деревянный ящик, к которому она прикреплена, произойдет взрыв). Мощность взрыва в полтора раза превышает мощность гранаты. Её можно ставить как на стены, так и на разные предметы, включая двери, ящики и даже пол. Большой плюс лазерной мины в том, что враги её заметить не могут. Также с их помощью можно забираться на различные объекты. Дверь с установленной на ней лазерной миной не открывается. Даётся в главе «Энергия».

Радиоуправляемая бомба: Пакет взрывчатки, оборудованный дистанционным взрывателем. Игрок может бросить пакет и вручную взорвать бомбу с пульта дистанционного управления. Стоит отметить, что при подгрузке уровня (они иногда происходят) мина теряется. Точнее, она остается там, где была, но уже не взрывается с пульта (игровой движок не сохраняет связь между бомбой и игроком при подгрузке следующей карты и она остается просто как объект). Также можно заложить несколько бомб сразу. При дистанционном подрыве они взорвутся одновременно. Мощность взрыва наравне с лазерной миной. Эффективна при большом скоплении врагов, а также для минирования участков. В целом, мало используется в процессе игры, но неожиданно полезна в битве против Нихиланта (её финальной части, в которой монстр «открывает» голову и больше её не закрывает) — достаточно, оттолкнувшись от упругой платформы, бросить все имеющиеся заряды (не меньше трех) в открытое отверстие и нажать на кнопку. Даётся в главе «Железная дорога».

Снарки («Клопы»)(Инопланетное оружие): Очень специфический тип оружия. Снарк — это мелкая внеземная форма жизни, похожая на крупных плотоядных жуков (размером с кулак), встречающаяся в основном в гнездах по пять штук в каждом. Эффективны в бою только с наземными существами, при этом желательно находиться на некотором расстоянии от земли или набросать их в окно так, чтобы они не смогли добраться до игрока. Единственный их минус — уничтожив свою цель, они принимаются кусать любое стоящее поблизости существо (включая и игрока). Отнимают при каждом укусе по десять процентов жизни. Через определенное время, находясь вне гнезда, взрываются. Даются в главе «Сомнительная этика».