Впервые за всю серию игр Half-Life G-Man появляется без портфеля-дипломата во вступительной сцене игры.

Это первая игра из серии Half-Life, где Гордон начинает свои приключения не в вагоне поезда, но при этом игра заканчивается на поезде.

На одной из стен подземного гаража в главе «Обездоленные» можно заметить граффити и штрих-код. Под штрих-кодом написаны цифры 24724 — почтовый
индекс города, носящего название Фримен (США, штат Виргиния).

В Episode One встречается «Плачущая пара» — гэг из Half-Life 2, представляющий собой сидящих на диване угнетённых мужчину и женщину из Сопротивления.
Их можно найти в убежище повстанцев в главе «Побег из города». Позже, через щель в полу на втором этаже убежища можно подслушать их разговор, в
котором они высказывают своё мнение относительно происходящих событий.